Vorbereitung 3. Runde zur IBO 2021

Bitte stellen Sie sicher, dass Sie eine aktuelle Browservariante (z.B. Firefox, Chrome) installiert haben. Zudem wird für das Ausfüllen des Lösungsborgen, ein Tabellenkalkulationsprogramm (z.B. Excel oder Libreoffice Calc oder WPS Spreadsheets) benötigt. Um zu überpfrüfen, ob Ihr Computersystem den Inhalt des Bioinformatikserves korrekt darstellen kann, können Sie folgenden Demoserver nutzen:

https://antgenomes.org/blast/

Sie können einen Testlauf durchführen, indem Sie folgende Sequenz in die Maske eingeben und anschließend eine Protein Datenbank auswählen:

>lcl|NT_033779.5_prot_NP_477495.1_6 [gene=Adhr] [locus_tag=Dmel_CG3484] [db_xref=FLYBASE:FBpp0099544,GeneID:3772432] [protein=Adh-related, isoform A] [protein_id=NP_477495.1] [location=join(14617548..14617643,14618070..14618474,14618526..14618843)] [gbkey=CDS]
MFDLTGKHVCYVADCGGIALETSKVLMTKNIAKLAILQSTENPQAIAQLQSIKPSTQIFFWTYDVTMARE
DMKKYFDEVMVQMDYIDVLINGATLCDENNIDATINTNLTGMMNTVATVLPYMDRKMGGTGGLIVNVTSV
IGLDPSPVFCAYSASKFGVIGFTRSLADPLYYSQNGVAVMAVCCGPTRVFVDRELKAFLEYGQSFADRLR
RAPCQSTSVCGQNIVNAIERSENGQIWIADKGGLELVKLHWYWHMADQFVHYMQSNDEEDQD

Wenn Sie Acromyrmex echinatior proteins 3.8 auswählen und auf BlastP drücken, sollte das Ergebnis folgendermaßen aussehen:

Bei weiteren Fragen bzw. Problemen bitte ich um ein Email (siehe @ Symbol oben rechts).

2023 EvoGen Lab (PI Gossmann).